MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae SPNA45

Total Repeats: 32614

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018594	TCA	2	6	280	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405759924
2	NC_018594	GAAATG	2	12	327	338	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	405759924
3	NC_018594	AAC	2	6	349	354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405759924
4	NC_018594	ATT	2	6	363	368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405759924
5	NC_018594	GTA	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759924
6	NC_018594	GAA	2	6	456	461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759924
7	NC_018594	AAAAG	2	10	530	539	80 %	0 %	20 %	0 %	405759924
8	NC_018594	GGA	2	6	648	653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405759924
9	NC_018594	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405759924
10	NC_018594	GAAAT	2	10	691	700	60 %	20 %	20 %	0 %	405759924
11	NC_018594	A	6	6	704	709	100 %	0 %	0 %	0 %	405759924
12	NC_018594	AT	3	6	731	736	50 %	50 %	0 %	0 %	405759924
13	NC_018594	TTA	2	6	751	756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405759924
14	NC_018594	GAT	2	6	837	842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759924
15	NC_018594	A	7	7	860	866	100 %	0 %	0 %	0 %	405759924
16	NC_018594	GAA	2	6	879	884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759924
17	NC_018594	GAG	2	6	972	977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405759924
18	NC_018594	A	8	8	1184	1191	100 %	0 %	0 %	0 %	405759924
19	NC_018594	TGC	2	6	1214	1219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405759924
20	NC_018594	ATA	2	6	1402	1407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405759924
21	NC_018594	GGAA	2	8	1423	1430	50 %	0 %	50 %	0 %	405759924
22	NC_018594	TCAT	2	8	1456	1463	25 %	50 %	0 %	25 %	405759924
23	NC_018594	AAAAT	2	10	1473	1482	80 %	20 %	0 %	0 %	405759924
24	NC_018594	TGAT	2	8	1486	1493	25 %	50 %	25 %	0 %	405759924
25	NC_018594	AATC	2	8	1522	1529	50 %	25 %	0 %	25 %	405759924
26	NC_018594	AAT	2	6	1543	1548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405759924
27	NC_018594	TAA	2	6	1732	1737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405759925
28	NC_018594	ATTT	2	8	1740	1747	25 %	75 %	0 %	0 %	405759925
29	NC_018594	TAC	2	6	1762	1767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405759925
30	NC_018594	AG	3	6	1770	1775	50 %	0 %	50 %	0 %	405759925
31	NC_018594	A	7	7	1893	1899	100 %	0 %	0 %	0 %	405759925
32	NC_018594	CTT	2	6	1923	1928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405759925
33	NC_018594	CTT	2	6	1940	1945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405759925
34	NC_018594	CTT	2	6	1950	1955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405759925
35	NC_018594	GTA	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759925
36	NC_018594	AGCA	2	8	2104	2111	50 %	0 %	25 %	25 %	405759925
37	NC_018594	ATT	2	6	2147	2152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405759925
38	NC_018594	TGC	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405759925
39	NC_018594	AG	3	6	2182	2187	50 %	0 %	50 %	0 %	405759925
40	NC_018594	A	6	6	2276	2281	100 %	0 %	0 %	0 %	405759925
41	NC_018594	A	7	7	2292	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	405759925
42	NC_018594	TGA	2	6	2302	2307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759925
43	NC_018594	GAT	2	6	2363	2368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759925
44	NC_018594	ACT	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405759925
45	NC_018594	GTT	2	6	2606	2611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405759925
46	NC_018594	GTAAA	2	10	2640	2649	60 %	20 %	20 %	0 %	405759925
47	NC_018594	GAA	2	6	2651	2656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759925
48	NC_018594	ACTT	2	8	2708	2715	25 %	50 %	0 %	25 %	405759925
49	NC_018594	GATT	2	8	2716	2723	25 %	50 %	25 %	0 %	405759925
50	NC_018594	CAG	2	6	2796	2801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405759925
51	NC_018594	TTG	2	6	2935	2940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405759926
52	NC_018594	A	6	6	2946	2951	100 %	0 %	0 %	0 %	405759926
53	NC_018594	AAAAT	2	10	3027	3036	80 %	20 %	0 %	0 %	405759926
54	NC_018594	TGT	2	6	3053	3058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405759926
55	NC_018594	ATG	2	6	3060	3065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759926
56	NC_018594	ATT	2	6	3099	3104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405759926
57	NC_018594	CAG	2	6	3204	3209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405759927
58	NC_018594	GCA	2	6	3278	3283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405759927
59	NC_018594	TGG	2	6	3321	3326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405759927
60	NC_018594	AACT	2	8	3351	3358	50 %	25 %	0 %	25 %	405759927
61	NC_018594	TGA	3	9	3514	3522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759927
62	NC_018594	AATT	2	8	3597	3604	50 %	50 %	0 %	0 %	405759927
63	NC_018594	TTC	2	6	3699	3704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	405759927
64	NC_018594	AGA	2	6	3724	3729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759927
65	NC_018594	GAC	2	6	3799	3804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405759927
66	NC_018594	CAAA	2	8	3874	3881	75 %	0 %	0 %	25 %	405759927
67	NC_018594	AGT	2	6	3913	3918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759927
68	NC_018594	GAA	2	6	3941	3946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759927
69	NC_018594	GAT	2	6	3959	3964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759927
70	NC_018594	A	6	6	3971	3976	100 %	0 %	0 %	0 %	405759927
71	NC_018594	CTTG	2	8	4042	4049	0 %	50 %	25 %	25 %	405759927
72	NC_018594	ACTT	2	8	4058	4065	25 %	50 %	0 %	25 %	405759927
73	NC_018594	AAG	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759927
74	NC_018594	CTC	2	6	4119	4124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	405759927
75	NC_018594	AGC	2	6	4126	4131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405759927
76	NC_018594	TAT	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405759927
77	NC_018594	AAG	2	6	4227	4232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759927
78	NC_018594	GAA	2	6	4247	4252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759927
79	NC_018594	AT	3	6	4261	4266	50 %	50 %	0 %	0 %	405759927
80	NC_018594	AAAT	2	8	4374	4381	75 %	25 %	0 %	0 %	405759928
81	NC_018594	TTGA	2	8	4455	4462	25 %	50 %	25 %	0 %	405759928
82	NC_018594	GAA	2	6	4472	4477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759928
83	NC_018594	AC	3	6	4494	4499	50 %	0 %	0 %	50 %	405759928
84	NC_018594	A	6	6	4546	4551	100 %	0 %	0 %	0 %	405759928
85	NC_018594	ATGA	2	8	4578	4585	50 %	25 %	25 %	0 %	405759928
86	NC_018594	TTA	2	6	4608	4613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405759928
87	NC_018594	GAT	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759928
88	NC_018594	CAG	2	6	4705	4710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	405759928
89	NC_018594	TAT	2	6	4733	4738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405759928
90	NC_018594	ATTGGA	2	12	4776	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759928
91	NC_018594	GTT	2	6	4809	4814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405759928
92	NC_018594	CAT	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405759928
93	NC_018594	GAT	2	6	4842	4847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759928
94	NC_018594	ACT	2	6	4894	4899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405759928
95	NC_018594	TTA	2	6	4959	4964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405759929
96	NC_018594	A	6	6	4992	4997	100 %	0 %	0 %	0 %	405759929
97	NC_018594	CTA	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405759929
98	NC_018594	TTGCAA	2	12	5065	5076	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	405759929
99	NC_018594	AGA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759929
100	NC_018594	TATC	2	8	5155	5162	25 %	50 %	0 %	25 %	405759929
101	NC_018594	GAT	2	6	5196	5201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759929
102	NC_018594	TGG	2	6	5209	5214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	405759929
103	NC_018594	A	6	6	5236	5241	100 %	0 %	0 %	0 %	405759929
104	NC_018594	T	6	6	5267	5272	0 %	100 %	0 %	0 %	405759929
105	NC_018594	GATT	2	8	5323	5330	25 %	50 %	25 %	0 %	405759929
106	NC_018594	GAA	2	6	5382	5387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759929
107	NC_018594	GAG	2	6	5476	5481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405759929
108	NC_018594	GAATT	2	10	5524	5533	40 %	40 %	20 %	0 %	405759929
109	NC_018594	T	6	6	5532	5537	0 %	100 %	0 %	0 %	405759929
110	NC_018594	TGA	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759929
111	NC_018594	GAAA	2	8	5588	5595	75 %	0 %	25 %	0 %	405759929
112	NC_018594	GA	3	6	5639	5644	50 %	0 %	50 %	0 %	405759929
113	NC_018594	AGA	2	6	5723	5728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759929
114	NC_018594	TGA	2	6	5849	5854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759929
115	NC_018594	TGA	2	6	5866	5871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759929
116	NC_018594	AGA	2	6	5915	5920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759929
117	NC_018594	AAT	2	6	5928	5933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	405759929
118	NC_018594	A	6	6	5982	5987	100 %	0 %	0 %	0 %	405759929
119	NC_018594	TCAAT	2	10	6056	6065	40 %	40 %	0 %	20 %	405759929
120	NC_018594	TTTTC	2	10	6096	6105	0 %	80 %	0 %	20 %	405759929
121	NC_018594	AGA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	405759929
122	NC_018594	A	7	7	6129	6135	100 %	0 %	0 %	0 %	405759929
123	NC_018594	ATT	2	6	6147	6152	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	405759929
124	NC_018594	GGA	2	6	6188	6193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	405759929
125	NC_018594	CGT	2	6	6357	6362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	405759929
126	NC_018594	ACA	2	6	6371	6376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	405759929
127	NC_018594	AG	3	6	6389	6394	50 %	0 %	50 %	0 %	405759929
128	NC_018594	TGT	2	6	6431	6436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	405759929
129	NC_018594	CAT	2	6	6438	6443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405759929
130	NC_018594	AT	3	6	6578	6583	50 %	50 %	0 %	0 %	405759929
131	NC_018594	TAAAT	2	10	6614	6623	60 %	40 %	0 %	0 %	405759929
132	NC_018594	TGA	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759929
133	NC_018594	ACTCT	2	10	6695	6704	20 %	40 %	0 %	40 %	405759929
134	NC_018594	TGA	4	12	6740	6751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759929
135	NC_018594	TGA	2	6	6764	6769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759929
136	NC_018594	GTA	2	6	6805	6810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759929
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141	NC_018594	TGA	2	6	7169	7174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759929
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262	NC_018594	TAC	2	6	12701	12706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	405759936
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264	NC_018594	ATG	2	6	12843	12848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	405759936
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400	NC_018594	T	6	6	27749	27754	0 %	100 %	0 %	0 %	405759942
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